骨组织工程中，常用的脱细胞方法主要为酶消化法、渗透溶液法和去污剂清洗法。

酶消化法是利用酶的消化作用破坏细胞膜和细胞器，使细胞与基质分离，从而达到脱细胞目的。常用的酶有胰蛋白酶、中性蛋白酶、DNAse 和RNAse。

渗透溶液法是借助细胞内外渗透压的差别，破坏细胞膜，使细胞与基质分离，从而获得脱细胞基质。渗透溶液法分为高渗、低渗两种方法，有研究证实高渗溶液法比低渗溶液法更为有效。

去污剂清洗法最常用的试剂为在溶液中稳定性强的Triton X-100，它属于非离子型表面活性剂，能与细胞膜中的磷脂结合形成复合物，溶解于溶液中，并且其疏水端可以和膜蛋白结合破坏细胞膜，从而溶解破坏细胞。酶消化法脱细胞彻底，但对基质破坏作用强，不利于细胞外基质的保留；渗透溶液法简单、方便，但脱细胞能力有限；非离子型去污剂Triton X-100 作用温和。所以，要获得较理想的脱细胞效果，往往需要多种方法联合应用。

其他：运用经典的联合脱细胞方法制备ABECM。

用15%的过氧化氢和90 %的乙醚脱细胞。

用改良联合脱细胞方法制作脱细胞骨基质，并将其与兔骨髓基质干细胞复合成功修复兔桡骨中段骨缺损。

利用表面脱钙骨基质明胶（SDBMG） 修复大块骨缺损的实验中，X 线片显示SDBMG术后密度逐渐增高，自体骨则先降后升的现象，表明天然骨支架材料植入动物体内先脱钙吸收后成骨的变化特点，可在最大限度保存ABECM 力学性能的前提下部分脱钙在体外完成，植入体内后，较快进入成骨阶段，从而提高骨修复能力。

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